ChIP实验Ⅰ转录因子调控启动子验证方案

染色质免疫共沉淀（Chromatin Immunoprecipitation，ChIP）实验，是一项研究蛋白质与 DNA 相互作用的经典实验，用以确定目的蛋白在染色质上的定位。

ChIP 实验的应用领域很多，包括组蛋白修饰研究、DNA复制与损伤相关因子结合分析、基因的转录调控研究等。同时，ChIP-seq 测序分析，基于全基因组水平的 DNA－蛋白间互作的高通量筛选，常应用于表观遗传学、胚胎发育、肿瘤疾病等领域。

在基因功能相关研究中，ChIP 实验多用来验证转录因子与下游靶基因启动子的结合情况：

•若转录因子的下游基因已知，则可以通过 ChIP-PCR 实验验证二者的结合；

•若转录因子的下游基因未知，则可以通过 ChIP-seq 实验的测序结果，寻找转录因子调控的下游靶基因。

ChIP 实验操作步骤较为复杂，需要丰富的技术经验，在实验的过程中，需要根据不同情况优化实验复方案，摸索最适的实验条件，才能得到可靠的实验结果。对于刚开始接触ChIP实验的老师，可能会对实验产生疑惑，为了便于大家理解实验原理和操作步骤，我们整理了ChIP实验的大致流程，如图1所示：

 

 

图1 ChIP 实验流程图

另外，关于转录因子与下游靶基因启动子的结合验证，除了本文介绍的ChIP实验，还可以同时进行启动子双荧光素酶实验，结合两个实验的结果，进一步验证转录因子与下游靶基因启动子的结合，提高结果的可信度。

吉玛基因提供经验丰富的ChIP实验和启动子双荧光素酶实验服务项目，为初入实验室的您，解决实验操作难的困扰。如果您的课题研究涉及该两项实验，欢迎垂询！